Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NKX1-1Q15270 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NKX1-1Q15270 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NKX1-1Q15270 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms