Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKD1Q15139 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKD1Q15139 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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