Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD4Q14839 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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CHD4Q14839 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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CHD4Q14839 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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CHD4Q14839 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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