Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A6Q14031 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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