Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK13Q14004 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK13Q14004 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms