Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1CQ13936 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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