Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP1Q13829 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP1Q13829 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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