Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CUL3Q13618 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL3Q13618 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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