Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YHR140WYHR140W 720 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 NKP2YLR315W 462 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 IDI1YPL117C 867 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 GDT1YBR187W 843 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 FAA1YOR317W 2103 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 DPH6YLR143W 2058 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 PPZ1YML016C 2079 nt3.77□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 SPO73YER046W 432 nt3.76□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YIL171WYIL171W 330 nt3.76□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 SOP4YJL192C 705 nt3.76□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 NIS1YNL078W 1224 nt3.76□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 SWH1YAR042W 3567 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 AVT7YIL088C 1473 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 ALG6YOR002W 1635 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 PRP11YDL043C 801 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 NTR2YKR022C 969 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YBL010CYBL010C 843 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YNG1YOR064C 660 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 RTC1YOL138C 4026 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 MCM7YBR202W 2538 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 LAS1YKR063C 1509 nt3.75□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 GAD1YMR250W 1758 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 RXT3YDL076C 885 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 TRM8YDL201W 861 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YDR274CYDR274C 372 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YDR526CYDR526C 471 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 HCA4YJL033W 2313 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 IKS1YJL057C 2004 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 NCR1YPL006W 3513 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 PNG1YPL096W 1092 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YPL278CYPL278C 303 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 SWI1YPL016W 3945 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 MST1YKL194C 1389 nt3.74□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 SLM5YCR024C 1479 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 LYP1YNL268W 1836 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 NBP2YDR162C 711 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YHR214WYHR214W 612 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YIL165CYIL165C 360 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YAR066WYAR066W 612 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 SEC72YLR292C 582 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 SWC7YLR385C 399 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 MMT1YMR177W 1533 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 XRS2YDR369C 2565 nt3.73□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 JHD2YJR119C 2187 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 RAD26YJR035W 3258 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 YDR401WYDR401W 564 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 RFC2YJR068W 1062 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 RRN9YMR270C 1098 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 EFM2YBR271W 1260 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 ARG4YHR018C 1392 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 BRE4YDL231C 3378 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 DIT2YDR402C 1470 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 AZR1YGR224W 1842 nt3.72□□□□□ -1.81
RTR2Q12378 KRE28YDR532C 1158 nt3.71□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YMR114CYMR114C 1107 nt3.71□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 SPT6YGR116W 4356 nt3.71□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 STB3YDR169C 1542 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 MCD4YKL165C 2760 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 URA7YBL039C 1740 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 ZDS1YMR273C 2748 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 NUS1YDL193W 1128 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YER076CYER076C 909 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 NOP13YNL175C 1212 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 MFM1YPL060W 1242 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 DHR2YKL078W 2208 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YIL001WYIL001W 1542 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 TAF8YML114C 1533 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 MET17YLR303W 1335 nt3.7□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 IXR1YKL032C 1794 nt3.69□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 ASP1YDR321W 1146 nt3.69□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 SAE3YHR079C-A 276 nt3.69□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 GEP4YHR100C 558 nt3.69□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YHR112CYHR112C 1137 nt3.69□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 AIR1YIL079C 1083 nt3.69□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YRA2YKL214C 612 nt3.69□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 SPC34YKR037C 888 nt3.69□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 TAF6YGL112C 1551 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YGL140CYGL140C 3660 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YGL108CYGL108C 423 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 RPL15BYMR121C 615 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YNL181WYNL181W 1224 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 MSS116YDR194C 1995 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 ACE2YLR131C 2313 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YOR022CYOR022C 2148 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 FRT2YAL028W 1587 nt3.68□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YER077CYER077C 2067 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 RAD57YDR004W 1383 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 SEG1YMR086W 2883 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 ADP1YCR011C 3150 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 OAR1YKL055C 837 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 MYO3YKL129C 3819 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 YLR407WYLR407W 687 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 NUP159YIL115C 4383 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 GAC1YOR178C 2382 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 VPS36YLR417W 1701 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 RAD54YGL163C 2697 nt3.67□□□□□ -1.82
RTR2Q12378 ELM1YKL048C 1923 nt3.66□□□□□ -1.82
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