Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY1Q0D2K3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms