Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID5AQ03989 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID5AQ03989 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms