Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TOP2BQ02880 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms