Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A2Q01362 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A2Q01362 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms