Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY3P57055 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms