Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR5P51681 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR5P51681 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR5P51681 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR5P51681 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR5P51681 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR5P51681 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR5P51681 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR5P51681 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR5P51681 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR5P51681 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR5P51681 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR5P51681 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR5P51681 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR5P51681 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR5P51681 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR5P51681 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR5P51681 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR5P51681 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR5P51681 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR5P51681 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR5P51681 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR5P51681 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR5P51681 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR5P51681 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR5P51681 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR5P51681 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR5P51681 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR5P51681 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR5P51681 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR5P51681 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR5P51681 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR5P51681 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR5P51681 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms