Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATMP50440 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATMP50440 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATMP50440 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATMP50440 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATMP50440 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATMP50440 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATMP50440 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATMP50440 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GATMP50440 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GATMP50440 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATMP50440 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATMP50440 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATMP50440 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATMP50440 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATMP50440 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATMP50440 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATMP50440 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATMP50440 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATMP50440 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATMP50440 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATMP50440 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATMP50440 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATMP50440 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATMP50440 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATMP50440 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATMP50440 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATMP50440 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATMP50440 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATMP50440 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATMP50440 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GATMP50440 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms