Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPFP49454 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPFP49454 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPFP49454 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPFP49454 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPFP49454 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPFP49454 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPFP49454 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPFP49454 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPFP49454 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPFP49454 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPFP49454 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPFP49454 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPFP49454 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPFP49454 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPFP49454 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPFP49454 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPFP49454 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPFP49454 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPFP49454 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPFP49454 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPFP49454 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPFP49454 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPFP49454 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPFP49454 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPFP49454 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPFP49454 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPFP49454 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPFP49454 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPFP49454 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPFP49454 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPFP49454 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPFP49454 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPFP49454 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPFP49454 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPFP49454 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms