Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
AMPHP49418 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AMPHP49418 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
AMPHP49418 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AMPHP49418 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AMPHP49418 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AMPHP49418 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AMPHP49418 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AMPHP49418 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AMPHP49418 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AMPHP49418 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AMPHP49418 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AMPHP49418 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AMPHP49418 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AMPHP49418 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
AMPHP49418 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
AMPHP49418 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
AMPHP49418 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
AMPHP49418 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AMPHP49418 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
AMPHP49418 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
AMPHP49418 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
AMPHP49418 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
AMPHP49418 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AMPHP49418 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AMPHP49418 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AMPHP49418 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AMPHP49418 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms