Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMAN1P49257 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms