Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MDH1P40925 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MDH1P40925 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDH1P40925 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDH1P40925 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDH1P40925 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDH1P40925 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDH1P40925 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH1P40925 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH1P40925 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH1P40925 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH1P40925 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH1P40925 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH1P40925 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDH1P40925 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDH1P40925 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MDH1P40925 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDH1P40925 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH1P40925 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH1P40925 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH1P40925 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH1P40925 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH1P40925 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH1P40925 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MDH1P40925 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH1P40925 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH1P40925 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH1P40925 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH1P40925 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH1P40925 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH1P40925 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDH1P40925 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms