Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARL1P40616 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARL1P40616 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARL1P40616 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARL1P40616 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARL1P40616 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL1P40616 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL1P40616 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL1P40616 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL1P40616 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL1P40616 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL1P40616 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL1P40616 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARL1P40616 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARL1P40616 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARL1P40616 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms