Protein–RNA interactions for Protein: P38255

RXT2, Transcriptional regulatory protein RXT2, yeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RXT2	P38255	DHH1	YDL160C	1521 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RXT2	P38255	CDC6	YJL194W	1542 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RXT2	P38255	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.9	□□□□□ -1.62
RXT2	P38255	ENT5	YDR153C	1236 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	DCV1	YFR012W	609 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	RRN9	YMR270C	1098 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	YBR219C	YBR219C	384 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	RER1	YCL001W	567 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	YIL001W	YIL001W	1542 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	FOX2	YKR009C	2703 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	YJL215C	YJL215C	360 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	RPL15B	YMR121C	615 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	PHM7	YOL084W	2976 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	OM14	YBR230C	405 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	RGP1	YDR137W	1992 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	GAS2	YLR343W	1668 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	YGR125W	YGR125W	3111 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	BLM10	YFL007W	6432 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	OCA4	YCR095C	1089 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	DAS2	YDR020C	699 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	LPP1	YDR503C	825 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	FRA2	YGL220W	363 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	MRS3	YJL133W	945 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	FMP46	YKR049C	402 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	RRP40	YOL142W	723 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	SAT4	YCR008W	1812 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	PRP31	YGR091W	1485 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	IZH3	YLR023C	1632 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	JHD2	YJR119C	2187 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	LOH1	YJL038C	660 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	YBL010C	YBL010C	843 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	EGT2	YNL327W	3126 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	MET4	YNL103W	2019 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	GGA1	YDR358W	1674 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	GCR1	YPL075W	2358 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	GDH2	YDL215C	3279 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	OPT2	YPR194C	2634 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	RXT3	YDL076C	885 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	NUP42	YDR192C	1293 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	SRB5	YGR104C	924 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	NSE1	YLR007W	1011 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	YPR174C	YPR174C	666 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	TFA1	YKL028W	1449 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	APM1	YPL259C	1428 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	GDE1	YPL110C	3672 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	TAF12	YDR145W	1620 nt		4.86	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	SNO1	YMR095C	675 nt		4.85	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	AST1	YBL069W	1290 nt		4.85	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	FLO8	YER109C	2400 nt		4.85	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	DIT2	YDR402C	1470 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	PHO12	YHR215W	1404 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	PHO11	YAR071W	1404 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	RAD52	YML032C	1416 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	PCL10	YGL134W	1302 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	YCR050C	YCR050C	309 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	CNB1	YKL190W	528 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	NCE102	YPR149W	522 nt		4.84	□□□□□ -1.63
RXT2	P38255	STB3	YDR169C	1542 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	ENT1	YDL161W	1365 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	BUD13	YGL174W	801 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	YLR407W	YLR407W	687 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	TGS1	YPL157W	948 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	ARO7	YPR060C	771 nt		4.83	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	PDR5	YOR153W	4536 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	RRP1	YDR087C	837 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	KRE28	YDR532C	1158 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	CDC42	YLR229C	576 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	YNL181W	YNL181W	1224 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	DCS2	YOR173W	1062 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	SUA7	YPR086W	1038 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	THS1	YIL078W	2205 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	PRD1	YCL057W	2139 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.82	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	YDR056C	YDR056C	618 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	PFA5	YDR459C	1125 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	DSD1	YGL196W	1287 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	STV1	YMR054W	2673 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	MNN1	YER001W	2289 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	FRT2	YAL028W	1587 nt		4.81	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	YML020W	YML020W	1995 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	API2	YDR525W	330 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	RKM4	YDR257C	1485 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	SSA2	YLL024C	1920 nt		4.8	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	PRP19	YLL036C	1512 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	MOB2	YFL034C-B	864 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	YFR045W	YFR045W	930 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	TIM21	YGR033C	720 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64
RXT2	P38255	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms