Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGA1P29973 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms