Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Twist1P26687 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Twist1P26687 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Twist1P26687 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Twist1P26687 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Twist1P26687 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms