Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ME2P23368 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ME2P23368 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ME2P23368 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME2P23368 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME2P23368 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME2P23368 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME2P23368 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME2P23368 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME2P23368 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME2P23368 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME2P23368 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME2P23368 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME2P23368 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME2P23368 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ME2P23368 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms