Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTNP21246 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTNP21246 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTNP21246 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTNP21246 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTNP21246 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTNP21246 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTNP21246 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTNP21246 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTNP21246 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTNP21246 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTNP21246 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTNP21246 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTNP21246 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTNP21246 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTNP21246 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTNP21246 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTNP21246 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTNP21246 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTNP21246 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTNP21246 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTNP21246 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTNP21246 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTNP21246 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTNP21246 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms