Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD247P20963 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD247P20963 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD247P20963 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD247P20963 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CD247P20963 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CD247P20963 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD247P20963 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD247P20963 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD247P20963 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD247P20963 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD247P20963 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD247P20963 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD247P20963 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD247P20963 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD247P20963 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD247P20963 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD247P20963 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD247P20963 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD247P20963 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD247P20963 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD247P20963 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD247P20963 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD247P20963 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD247P20963 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CD247P20963 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD247P20963 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD247P20963 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms