Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6AP20340 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms