Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD53P19397 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD53P19397 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD53P19397 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD53P19397 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD53P19397 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD53P19397 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD53P19397 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD53P19397 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD53P19397 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD53P19397 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD53P19397 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD53P19397 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD53P19397 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD53P19397 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD53P19397 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD53P19397 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD53P19397 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD53P19397 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms