Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms