Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRAP18433 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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