Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DESP17661 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DESP17661 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DESP17661 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DESP17661 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DESP17661 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DESP17661 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DESP17661 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DESP17661 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DESP17661 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DESP17661 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DESP17661 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DESP17661 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DESP17661 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DESP17661 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DESP17661 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DESP17661 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DESP17661 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DESP17661 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DESP17661 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DESP17661 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DESP17661 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DESP17661 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DESP17661 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DESP17661 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DESP17661 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DESP17661 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DESP17661 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DESP17661 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DESP17661 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DESP17661 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DESP17661 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DESP17661 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DESP17661 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DESP17661 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DESP17661 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DESP17661 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DESP17661 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DESP17661 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DESP17661 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DESP17661 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DESP17661 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DESP17661 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DESP17661 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DESP17661 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DESP17661 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms