Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
P4HA1P13674 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4HA1P13674 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
P4HA1P13674 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms