Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I1P13073 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I1P13073 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I1P13073 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms