Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms