Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2AP11388 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
TOP2AP11388 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms