Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD8BP10966 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD8BP10966 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD8BP10966 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD8BP10966 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD8BP10966 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD8BP10966 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD8BP10966 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD8BP10966 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD8BP10966 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD8BP10966 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD8BP10966 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD8BP10966 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD8BP10966 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD8BP10966 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms