Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP10827 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP10827 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP10827 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP10827 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THRAP10827 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THRAP10827 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
THRAP10827 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THRAP10827 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THRAP10827 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THRAP10827 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms