Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC192P0DO97 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC192P0DO97 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC192P0DO97 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms