Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 CKS1YBR135W 453 nt5.36□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 snR7-LsnR7-L 214 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 YGR139WYGR139W 339 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 ALT2YDR111C 1524 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 PHO84YML123C 1764 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 MTC4YBR255W 2085 nt5.35□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 RRN6YBL014C 2685 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 NCR1YPL006W 3513 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 MBB1YJL199C 327 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 CKA2YOR061W 1020 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 OSW1YOR255W 837 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 RPN2YIL075C 2838 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 TOS3YGL179C 1683 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 TAF8YML114C 1533 nt5.34□□□□□ -1.55
YRF1-8P0CX22 DAM1YGR113W 1032 nt5.34□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt5.34□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 MCM7YBR202W 2538 nt5.34□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 CYK3YDL117W 2658 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 HIM1YDR317W 1245 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 AIM3YBR108W 2844 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 TCB3YML072C 4638 nt5.33□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 SIW14YNL032W 846 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 PSF3YOL146W 585 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 SHQ1YIL104C 1524 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt5.32□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 RPL15AYLR029C 615 nt5.31□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 APC1YNL172W 5247 nt5.3□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 YHR180WYHR180W 492 nt5.3□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 USB1YLR132C 873 nt5.3□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 COG5YNL051W 1212 nt5.3□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 SLI1YGR212W 1407 nt5.3□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 DIP2YLR129W 2832 nt5.29□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 IRC9YJL142C 393 nt5.29□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 TMA19YKL056C 504 nt5.29□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 RSC1YGR056W 2787 nt5.29□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 OAF1YAL051W 3144 nt5.29□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 YFR035CYFR035C 345 nt5.29□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 COX11YPL132W 903 nt5.29□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 MSD1YPL104W 1977 nt5.28□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 ISR1YPR106W 1332 nt5.28□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 ADD66YKL206C 804 nt5.28□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 PHO90YJL198W 2646 nt5.28□□□□□ -1.56
YRF1-8P0CX22 DRS1YLL008W 2259 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 PRE4YFR050C 801 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 MRPL51YPR100W 423 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 SRP72YPL210C 1923 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 IDS2YJL146W 1410 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 AKR1YDR264C 2295 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 TPS3YMR261C 3165 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 ACE2YLR131C 2313 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 MRH1YDR033W 963 nt5.27□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 YTM1YOR272W 1383 nt5.26□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 YNR063WYNR063W 1824 nt5.25□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 EMP70YLR083C 2004 nt5.25□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 APC9YLR102C 798 nt5.25□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 YOR387CYOR387C 621 nt5.25□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 SRP101YDR292C 1866 nt5.25□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 YCL075WYCL075W 441 nt5.24□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 YDL094CYDL094C 510 nt5.24□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 YGR107WYGR107W 450 nt5.24□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 CPA1YOR303W 1236 nt5.24□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 TRM1YDR120C 1713 nt5.23□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 YCR006CYCR006C 474 nt5.23□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 STI1YOR027W 1770 nt5.23□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 GAL4YPL248C 2646 nt5.23□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 ROG3YFR022W 2202 nt5.22□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 COA4YLR218C 453 nt5.22□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 SUE1YPR151C 621 nt5.22□□□□□ -1.57
YRF1-8P0CX22 OMS1YDR316W 1416 nt5.21□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 UTP9YHR196W 1728 nt5.21□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 PTA1YAL043C 2358 nt5.2□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 OLE1YGL055W 1533 nt5.2□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 APC11YDL008W 498 nt5.2□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 ERJ5YFR041C 888 nt5.2□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 DAL4YIR028W 1908 nt5.2□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 POL3YDL102W 3294 nt5.2□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 YGR053CYGR053C 852 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 NAT3YPR131C 588 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 SIT1YEL065W 1887 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 YPL216WYPL216W 3309 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 FLO5YHR211W 3228 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 TUP1YCR084C 2142 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 BNA5YLR231C 1362 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 SPT15YER148W 723 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 COX23YHR116W 456 nt5.19□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 BUD14YAR014C 2130 nt5.18□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 HOM3YER052C 1584 nt5.18□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 FAS2YPL231W 5664 nt5.18□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 NMT1YLR195C 1368 nt5.18□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 YDR444WYDR444W 2064 nt5.17□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 SVF1YDR346C 1446 nt5.17□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 RIM9YMR063W 720 nt5.16□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 MSR1YHR091C 1932 nt5.16□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 TRX3YCR083W 384 nt5.16□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 YKL050CYKL050C 2769 nt5.16□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 BMH1YER177W 804 nt5.15□□□□□ -1.58
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