Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKHD1P08F94 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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