Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYCNP04198 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYCNP04198 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYCNP04198 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYCNP04198 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYCNP04198 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYCNP04198 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYCNP04198 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYCNP04198 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYCNP04198 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYCNP04198 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYCNP04198 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYCNP04198 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYCNP04198 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYCNP04198 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYCNP04198 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYCNP04198 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYCNP04198 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYCNP04198 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYCNP04198 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYCNP04198 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYCNP04198 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYCNP04198 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYCNP04198 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYCNP04198 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYCNP04198 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYCNP04198 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYCNP04198 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms