Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV1-5P01602 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms