Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBB3O95704 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APBB3O95704 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBB3O95704 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APBB3O95704 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APBB3O95704 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APBB3O95704 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APBB3O95704 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APBB3O95704 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APBB3O95704 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APBB3O95704 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms