Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24DO94855 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms