Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH16O75309 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH16O75309 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH16O75309 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH16O75309 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH16O75309 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH16O75309 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH16O75309 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH16O75309 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH16O75309 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH16O75309 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH16O75309 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH16O75309 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH16O75309 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH16O75309 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH16O75309 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH16O75309 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH16O75309 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH16O75309 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH16O75309 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH16O75309 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH16O75309 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH16O75309 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH16O75309 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH16O75309 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH16O75309 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH16O75309 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH16O75309 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH16O75309 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH16O75309 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH16O75309 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH16O75309 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH16O75309 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH16O75309 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH16O75309 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH16O75309 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH16O75309 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH16O75309 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH16O75309 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH16O75309 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH16O75309 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH16O75309 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH16O75309 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms