Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYNMO15061 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYNMO15061 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYNMO15061 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SYNMO15061 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYNMO15061 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SYNMO15061 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNMO15061 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNMO15061 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNMO15061 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNMO15061 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNMO15061 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNMO15061 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYNMO15061 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNMO15061 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYNMO15061 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYNMO15061 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYNMO15061 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYNMO15061 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYNMO15061 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNMO15061 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNMO15061 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNMO15061 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYNMO15061 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYNMO15061 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYNMO15061 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYNMO15061 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYNMO15061 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNMO15061 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNMO15061 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNMO15061 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNMO15061 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNMO15061 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNMO15061 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYNMO15061 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms