Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN7AO14910 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN7AO14910 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN7AO14910 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms