Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APAF1O14727 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APAF1O14727 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APAF1O14727 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APAF1O14727 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APAF1O14727 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APAF1O14727 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APAF1O14727 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
APAF1O14727 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APAF1O14727 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APAF1O14727 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APAF1O14727 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APAF1O14727 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APAF1O14727 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APAF1O14727 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APAF1O14727 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APAF1O14727 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APAF1O14727 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APAF1O14727 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
APAF1O14727 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APAF1O14727 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APAF1O14727 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APAF1O14727 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
APAF1O14727 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APAF1O14727 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APAF1O14727 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APAF1O14727 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
APAF1O14727 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APAF1O14727 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APAF1O14727 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APAF1O14727 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APAF1O14727 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APAF1O14727 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APAF1O14727 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APAF1O14727 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APAF1O14727 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APAF1O14727 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APAF1O14727 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APAF1O14727 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APAF1O14727 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APAF1O14727 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APAF1O14727 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APAF1O14727 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APAF1O14727 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APAF1O14727 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
APAF1O14727 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
APAF1O14727 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APAF1O14727 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APAF1O14727 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APAF1O14727 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APAF1O14727 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APAF1O14727 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APAF1O14727 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APAF1O14727 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APAF1O14727 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APAF1O14727 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APAF1O14727 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APAF1O14727 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APAF1O14727 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APAF1O14727 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
APAF1O14727 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
APAF1O14727 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APAF1O14727 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms