Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRTO14522 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRTO14522 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
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